De “Ask a Biologist”: http://www.askabiologist.org.uk/answers/viewtopic.php?id=3250
“Aunque las colas domésticas y de algodón pueden intentar reproducirse, los embriones normalmente mueren antes de nacer debido a la diferencia de cromosomas. Los conejos domésticos (europeos) tienen 22 pares de cromosomas, las colas de algodón tienen 21”
Así que la respuesta es técnicamente sí, podría resultar en bebés híbridos, aunque es muy poco probable que alguna descendencia sobreviva.
Como nota, hay animales híbridos con padres con un número diferente de cromosomas que son comunes, ya que la mula es la descendencia de un caballo y el burro, por ejemplo. El caballo tiene 64 y el burro 62. La mula termina con 63 cromosomas. Debido al número impar, la mula suele ser estéril, pero se han registrado muy pocos casos en los que una de ellas ha logrado reproducirse.
También se ha registrado un caso de animales tan distantes entre sí que eran de géneros diferentes (un grado más alejados que las especies) y que aún así se criaban para producir descendencia viva, ya que había descendencia producida a partir de un apareamiento entre una babirusa y un cerdo domesticado cuando ambos fueron puestos juntos en un zoológico. http://www.macroevolution.net/babirusa-domestic-pig-hybrids.html
En conclusión, siempre existe la posibilidad de una excepción, pero con mucho el resultado más probable es que no se produzca una descendencia viable.