Su gato no es raro, muchos gatos muestran este comportamiento. Podría ser sólo porque va a comprobar lo que estás haciendo, y luego ¡bum! Qué buena idea, compañero, usemos la caja de arena.
Cuando mi gato era joven, solía hacer esto cada vez que limpiaba la caja de arena, y la limpiaba una vez al día. Sin embargo, dejó de hacerlo cuando empecé a decirle “No” cada vez que lo intentaba.
Todavía le gusta venir a verme limpiarla cada vez, pero no entra. Espera hasta que termine y luego entra. Podría ser debido al hecho de que los gatos saben que la caja de arena está limpia y elegante cuando terminamos de limpiarla, así que trata de hacer las cosas más rápido usándola antes de que terminemos de limpiarla.
He leído que cuando un gato ve que alguien le quita las heces, le parece raro, y el gato empieza a estresarse o confundirse un poco por ello y por eso usa la caja de nuevo para guardar sus heces allí, no estoy seguro de en qué sitio he leído eso y por eso siento no poder ponerle un enlace aquí.
También podría ser porque su gato prefiere una caja abierta como dijo @Stig Tore. Y por cierto, deberías considerar limpiar la caja de arena una o dos veces al día, excepto si es una caja enorme.