Los peces tienen células llamadas cromatóforos que producen los pigmentos que dan la coloración o reflejan la luz. El color de un pez se determina en parte por los pigmentos que hay en las células (hay varios colores), cuántas moléculas de pigmento hay, y si el pigmento está agrupado dentro de la célula o está distribuido por todo el citoplasma.
Otra cosa es que, cuando los peces pierden su color, los cromatóforos espacian los gránulos de pigmento más lejos, y sus colores parecen más apagados. Acercándose más, los colores parecen más brillantes.
Así que básicamente, tu pez cuando descansa está conservando su energía, no hay necesidad de mantener su color.
PERO CUIDADO, hay muchas razones para que el color del pez se desvanezca en otros casos como el estrés, la mala calidad del agua, cuando se introduce a nuevos peces o cuando están enfermos. Así que si esto sólo ocurre cuando hay ausencia de luz o cuando descansan, es perfectamente normal.